След като години наред са били защитени от човешкия свят, братята костенурки се опитват да спечелят сърцата на нюйоркчани и да бъдат приети като нормални тийнейджъри чрез героични постъпки. Новата им приятелка Ейприл О'Нийл им помага да се справят с мистериозен престъпен синдикат, но скоро се оказва, че са надминали възможностите си, когато срещу тях е пусната армия от мутанти.